SnapGene 替代方案:免费的跨平台质粒图谱软件 GenePad
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直接打开既有 .dna 文件
把 SnapGene 的 .dna 质粒文件拖进 GenePad 即可打开:主序列、拓扑、features、引物与 notes 原样读入;编辑后仍可存回 .dna,传回给仍用 SnapGene 的导师或同事不会有格式障碍。

Addgene 下载的 .dna 质粒直接打开:环形/线性一键切换,元件按类别分层着色 - STEP 2 / 8
图谱、序列与酶切位点
图谱与序列双向联动:标注表中选定条目,序列视图即定位到对应碱基区间,同步显示选区长度、GC 含量与 Tm 值。酶切位点直接标注在双链序列上,悬停即可查看识别序列、链方向与上下切口位置,5′ 突出末端明确标示。

标注表中选中条目,序列视图自动定位并显示选区长度、GC 含量与 Tm 
酶切位点悬停详情:识别序列、切口位置与 5′ 突出末端 - STEP 3 / 8
Sanger 测序比对
导入 AB1 峰图文件,色谱、reads 与参考序列按碱基逐一对齐,结果给出比对一致率与 E-value,错配位点红色标示,逐个反应判断质量与错配位置。

AB1 峰图与参考序列逐碱基对齐,错配位点以红色标出 - STEP 4 / 8
通用元件识别与 sgRNA 设计
打开图谱即自动标出启动子、抗性基因、复制子等常见元件,内置元件库覆盖 20 个大类、逐条记录 NCBI 登录号;选中序列右键即可设计 sgRNA,支持 SpCas9、xCas9、Cas12a/b、TnpB 等 12 种识别布局,PAM 方向、种子区长度与脱靶过滤可配置,候选一键标注回图谱。

右键菜单直接调出 sgRNA 设计:12 种识别布局,候选可一键标注回图谱 - STEP 5 / 8
电泳模拟与蛋白属性
电泳模拟覆盖 DNA 琼脂糖凝胶与 SDS-PAGE 蛋白凝胶:内置 Trans2K® 等主流分子量标准,跑胶前预估条带位置;选中 CDS 还可实时计算分子量、等电点(内置 19 种算法)、GRAVY、脂肪族指数与消光系数。

DNA 电泳模拟:Trans2K® 分子量标准,酶切或 PCR 产物直接上样 
蛋白属性面板:分子量、等电点、GRAVY、脂肪族指数与消光系数 - STEP 6 / 8
NGS 数据查看
直接打开 fastq.gz / fastq / fq.gz / fq 文件(gzip 无需解压),双端 R1/R2 自动配对拼接,每个碱基按 Phred 质量着色;支持按氨基酸片段检索、锚点批量裁切,并一键生成文库丰度报告(可导出 CSV)。

双端 reads 逐条拼接,逐碱基按测序质量着色,右侧汇总统计 - STEP 7 / 8
基因文件库与 AI 助手
把散落各处的质粒文件统一建索引(只建索引,不改动原始文件),AI 依据序列与标注自动生成性质标签,监视文件夹自动收录;AI 助手可用一句话检索定位文件,也能查询通用元件的信息。

基因文件库:AI 批量生成标签,按标签或项目检索质粒 - STEP 8 / 8
多语言与「打开方式」
内置中、英、日、法、德、俄六种界面语言,还可用 AI 翻译接入任意语言;右键随时把文件交给 SnapGene、VS Code 等指定工具——GenePad 补位而不接管,两个工具共存不冲突。

语言设置:内置六种语言,支持导入与 AI 生成语言包 
「使用其它程序打开」:一键交给 SnapGene、VS Code 等工具
授权说明:GenePad 当前免费公测;公测结束后,图谱查看、编辑、保存等已有功能依旧免费。学术用户(高校、医院课题组、iGEM、学生)在 2026 年至 2027 年 12 月 31 日期间自动获得免费使用权限,无需申请;商业使用将由后续发布的 GenePad Pro 授权支持。工具箱中的分子克隆(Molecular Cloning)已上线部分功能,完整流程仍在开发中。