266 ELEMENTS · 20 CATEGORIES · GENBANK + FASTA
质粒构建通用元件序列库
genepad-commonfeaturesMIT从 NCBI 源参考质粒中逐条整理与核对的可复用元件序列库。每条元件均记录 NCBI 登录号与参考质粒名,序列来源可逐条回溯。导入质粒软件后,打开图谱即可自动识别这些常见元件。
数据规格
- 规模
- 266 个元件 · 20 个分类
- 溯源
- 每条元件记录 NCBI 登录号 + 参考质粒名
- 格式
- GenBank (.gb) + FASTA (.fa) 双格式
- 兼容
- SnapGene / Benchling common features 库导入即用
- 重建
- fetch_features.py · export.py · verify.py 质量门
- 许可
- MIT(元件序列为公共领域事实数据)
20 个覆盖分类
- 抗生素抗性14
- 复制起点12
- 原核启动子16
- 原核终止子6
- 原核调控15
- 哺乳动物启动子19
- 哺乳动物 polyA4
- 哺乳动物调控10
- 酵母元件17
- 植物元件8
- 昆虫元件4
- iGEM BioBrick 标准件30
- AAV 载体元件15
- 病毒载体元件9
- 蛋白标签34
- 荧光蛋白14
- 报告酶7
- 重组位点16
- 引物结合位点12
- 其他4
将 genbank/ 下的 .gb 导入 SnapGene 或 Benchling 的 common features 库,打开任意质粒图即可自动识别这些元件;fasta/ 下的 .fa 可直接用于 BLAST 比对。